Первая природоохранная служба на комбинате появилась ещё в 1964 году, когда в соответствии с постановлением Южно-Уральского совнархоза на промышленных предприятиях региона, в том числе и на ММК, создана водная лаборатория, основной задачей которой являлась охрана водоёмов, находящихся в спецпользовании предприятий. Она вошла в состав центральной лаборатории комбината, штат её состоял из 14 человек. В 1967-м для усиления контроля за выбросами в атмосферу в водной лаборатории создан новый участок, который в 1972-м при объединении с группой технологического контроля сероулавливающих установок и участком контроля атмосферы рабочих зон преобразован в лабораторию защиты атмосферы в составе ЦЛК. 11 мая 1989 года приказом генерального директора ММК на комбинате создана единая служба охраны окружающей среды.
Природоохранная служба комбината внесла немалый вклад в обеспечение экологической безопасности Магнитогорска. Валовые выбросы загрязняющих веществ в атмосферу Магнитки снизились более чем в четыре раза, в чём, конечно же, немалая заслуга и экологов комбината.
Снижение негативного воздействия на окружающую среду является одной из стратегических целей ПАО "ММК". Планируя долгосрочное и устойчивое развитие, комбинат придаёт первостепенное значение вопросам обеспечения экологической безопасности и совершенствования системы управления охраной окружающей среды. Производственная деятельность компании осуществляется в соответствии с требованиями законодательства России в области охраны окружающей среды и международного стандарта ISO 14001:2015. Затраты ММК на природоохранную деятельность в 2000-2018 годах превысили 58 млрд. рублей - в том числе 9 млрд. рублей только в прошлом году. В настоящее время экологическую безопасность производственных процессов ПАО "ММК" обеспечивает комплекс природоохранных сооружений, который состоит из 276 газоочистных установок; 45 локальных оборотных циклов водоснабжения и 55 водоочистных сооружений; 16 специализированных установок по переработке отходов производства.