А. А. Субботин уже работал в коллективе Орджоникидзевского районного суда г. Магнитогорска судьей, рассматривал уголовные дела (с 2004 по 2008 год). До того, как стать судьей, Александр Анатольевич работал следователем прокуратуры Правобережного района, затем - старшим следователем прокуратуры Магнитогорска. До 2001 года являлся прокурором криминалистом методико-криминалистического отдела в прокуратуре Челябинской области, после чего работал в должности заместителя прокурора в прокуратуре Орджоникидзевского района Магнитогорска. В 2004 году был назначен на должность судьи Орджоникидзевского районного суда Магнитогорска, с июля 2008 года - судьей Челябинского областного суда. Имеет третий квалификационный класс.