До последнего времени он был начальником управления архитектуры и градостроительства администрации Магнитогорска.
Департамент регулирования градостроительной деятельности - один из ключевых в регионе. В его ведении вопросы градостроительства, проектирования, строительства и промышленности, стройматериалов, реализации государственных капитальных вложений, экспертизы проектной документации, нормативно-правового регулирования, лицензирования и ряд других.
В Магнитке Илья Пономарев руководил управлением архитектуры и градостроительства с 2006 года. При нем проведена корректировка генерального плана города, рассчитанного до 2025 года и предопределяющего развитие муниципалитета на новом качественном уровне, разработан долгосрочный генеральный план развития и реконструкции городской транспортной схемы с ключевыми проектами - магистральной кольцевой трассой непрерывного движения и пятым мостовым переходом через Урал. Среди других проектов, реализованных при Илье Пономареве, - выработка правил землепользования и застройки Магнитогорска и карта градостроительного зонирования территории.